《X战警：第一战》将时间拨回上世纪六十年代，讲述X教授与万磁王年轻时的相遇与决裂。查尔斯·泽维尔出身优渥，坚信人类与变种人能和平共存；埃里克·兰谢尔历经纳粹迫害，对人类的仇恨根深蒂固。两人因共同的目标走到一起，招募了一批年轻变种人，包括魔形女、野兽、冲击波等，组建了最初的X战警团队。他们成功阻止了塞巴斯蒂安·肖企图挑起美苏核战争的阴谋。然而，古巴导弹危机成为转折点。人类对变种人的恐惧与攻击，让埃里克彻底走向极端，他杀死肖后选择与人类为敌。查尔斯在阻止过程中身受重伤，从此坐上轮椅。昔日挚友分道扬镳，X战警与兄弟会就此诞生，变种人的命运也走向截然不同的两条道路。