《宝贝老板》讲述七岁男孩提姆原本独享父母宠爱，生活幸福。然而一个穿着西装、提着公文包、举止像大人的婴儿突然出现，成了他的弟弟。提姆很快发现，这个弟弟并非普通婴儿，而是宝贝公司派出的特工，专门调查狗狗公司企图夺走人类对婴儿喜爱的阴谋。兄弟二人起初互相看不顺眼，提姆嫉妒弟弟夺走父母关注，弟弟则嫌弃提姆幼稚。但在追踪阴谋的过程中，他们被迫合作，经历了一系列爆笑又惊险的冒险。最终，他们联手揭穿了狗狗公司的计划，也真正理解了家人的意义。影片以天马行空的想象力，把婴儿的来历变成一场特工大战，在欢乐搞笑之余，传递出关于手足之情与家庭温暖的动人主题。