《云水怒》以1932年一·二八事变后的上海为背景，讲述爱国民族资本家云在天一家在动荡时局中的命运沉浮。淞沪停战协定签订后，战火虽暂歇，暗流却愈发汹涌。云在天因掌握日军经济侵略的关键账本，成为各方势力争夺的目标。他巧妙将证据藏匿，却不幸遇害。其子云飞岳、云飞川在不知父亲真实身份的情况下，逐步被卷入与日本特务、汉奸帮会的生死较量。兄弟二人从误解到携手，在中共地下党员的引导下，逐渐认清民族大义。他们历经绑架、追杀、离间与牺牲，最终将账本安全送出，揭露日军阴谋。剧集融合家族恩怨、谍战悬疑与抗日热血，展现乱世中小人物如何在家国危难间做出抉择，以云水之志，汇入抗日洪流。