《百合的故事》以2010年为时间节点，讲述中年女性石百合从日本返回中国黑龙江富锦县的归乡之旅。她此行背负着母亲的遗愿——将母亲骨灰带回故土，与已去世的父亲团聚。在富锦，她与儿时玩伴王虎子、建设重逢，尘封的记忆随之苏醒。影片以战争遗孤的身份为叙事核心，展现百合在中日两国之间的成长创伤与情感漂泊。童年时，她因历史动荡被遗弃在中国，后辗转赴日生活，一生都在两种文化、两个故乡之间寻找归属。母亲去世后，这份乡愁与身份困惑愈发沉重。导演通过细腻的镜头语言，将个人记忆与时代背景交织，呈现战争遗孤群体不为人知的内心世界。百合与虎子、建设的重逢，既有温情也有疏离，过去与现在不断碰撞。影片最终指向和解与放下：归乡不仅是完成母亲遗愿，更是百合与自我、与历史的一次深情对话。