《来自深海的他》讲述深海异族王子凌渊为寻回被人类打捞船意外带走的海灵珠，化名潜入滨海都市。海灵珠是维系深海结界的关键，一旦落入人类军方之手，两界平衡将被彻底打破。凌渊阴差阳错与海洋生物学女博士苏念合租。苏念理性冷静，对海洋生物异常敏感，很快发现这位新室友体温偏低、伤口愈合极快、且总在雨夜失踪。凌渊则用“深海恐惧症患者”身份掩饰，暗中利用控水异能追踪珠宝流向。随着深海追兵登岸与人类科研组织的介入，两人从互相试探走向联手。苏念通过实验数据帮助凌渊锁定海灵珠位置，凌渊则在危急时刻暴露鱼尾救下苏念。最终他们发现，海灵珠真正的力量并非统治海洋，而是维系两个物种共存的屏障。面对军方围捕与深海叛乱，两人选择共同守护这份跨越种族的秘密，也让一段来自深海的爱情浮出水面。